菲律宾大学是根据菲律宾首届立法机构颁发的第1870号法令（亦称大学宪章）于1908年6月18日创办的，实际上是依靠美国人，并按照兰德公司资助大学的模式，为菲律宾人开办的一所大学。该校的第一任校长是美国人默里·巴特利特博士（Murray Bartlett）。经过85年的发展，现已是菲律宾规模最大的国立综合性大学。建校之初，全校仅有两个教学单位，即1908年成立的美术学院和农学院。1910年，菲律宾医科学校（成立于1907年）并入菲律宾大学，并于1923年扩大为医学院。